Konkurs na stanowisko adiunkt/postdoc w projekcie NCN OPUS-23 (please scroll down for English)
„Biomechanika molekularna wariantów SARS-CoV-2: wiązanie wirus - komórka gospodarz i omijanie układu odpornościowego”
Instytucja: Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN
Stanowisko: adiunkt/postdoc
Dyscyplina naukowa: Inżynieria Biomedyczna
Termin składania ofert: 27 marca 2023
Pozycja zaczyna się: 7 kwietnia 2023
Czas trwania projektu: 3 lata
Kierownik projektu: dr. Adolfo Poma Bernaola
Słowa kluczowe: biofizyka obliczeniowa, symulacje molekularne
Opis Projektu:
Proponowane badania skoncentrują się na podstawach molekularnych biomechaniki wirusa SARS-CoV-2. W szczególności, planujemy zbadać białko kolca (S) i jego interakcje z ludzkim receptorem enzymu konwertującego angiotensynę 2 (hACE2) i neutralizację przeciwciał umożliwiającą omijanie systemu odpornościowego.
Profil kandydatów/wymagania:
- Ekspert w dziedzinie biofizyki obliczeniowej i/lub chemii ze szczególnym uwzględnieniem symulacji molekularnej
- Doświadczenie z polem siłowym MARTINI (lub podobnymi metodami) będzie uważane za mocny atut
- Zaawansowana znajomość pakietów GROMACS, NAMD lub AMBER
- Umiejętność programowania najlepiej python >2.7, c++, Lua oraz doświadczenie w pisaniu skryptów dla HPC
- Zdolność i zainteresowanie prezentacją wyników swoich badań na konferencjach krajowych i międzynarodowych
- Dobra znajomość języka angielskiego
- Rzetelność, kreatywność, umiejętność pracy w grupie interdyscyplinarnej
Oferujemy:
- Wynagrodzenie: 9750 zł brutto miesięcznie,
- Wsparcie wyjazdów na konferencje międzynarodowe
- Krótkie pobyty w laboratoriach naszych współpracowników w Holandii i Belgii
- Wsparcie w ubieganiu się o granty i przyjazne środowisko pracy
Wymagane dokumenty:
- List motywacyjny
- CV wraz z wykazem publikacji i konferencji
- Dyplom doktora z fizyki/biofizyki lub pokrewnej gałęzi nauki
- 2 listy referencyjne
- Podpisane oświadczenie: “Wyrażam zgodę na przetwarzanie danych osobowych zawartych w mojej ofercie pracy na potrzeby niezbędne do przeprowadzenia procesu rekrutacji prowadzonego przez IPPT PAN z siedzibą w Warszawie, ul. A. Pawińskiego 5B, zgodnie z art. 13 ust. 1 i 2 rozporządzenia (UE) 2016/679 Parlamentu i Rady z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w zakresie przetwarzania danych osobowych i swobodnego przepływu tych danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46 / WE (RODO)”
Prosimy o przesłanie dokumentów na adres: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. oraz kopia (CC) do Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
Więcej informacji na temat stanowiska można znaleźć na stronie: http://pomalab.ippt.pan.pl/web/positions
Post-doc/assistant professor offer within the NCN OPUS-23 scientific project
“Molecular biomechanics of the SARS-CoV-2 variants: The virus-host cell attachment and immune evasion”
INSTITUTION: Institute of Fundamental Technological Research, Polish Academy of Sciences
Position in the project: postdoc/assistant professor
Scientific discipline: Biomedical engineering
Deadline: March 27, 2023
Position starts on April 7, 2023
Project duration 3 years
Project Leader dr. Adolfo Poma Bernaola
Key words: Computational Biophysics, molecular simulation
Project Description
This research will focus on the foundation of the molecular biomechanics of the SARS-CoV-2. Here we plan to investigate the spike (S) protein and its interaction with the human angiotensin-converting enzyme 2 (hACE2) receptor and neutralising antibodies (Ab) responsible for the immune evasion. For this work will employ state-of-the-art MARTINI 3 description of proteins and single-molecule force spectroscopy (SMFS) data for the improvement of the computational model. The selected person will participate in ongoing research in the field of the nanomechanics of proteins as well as in the development of the GōMARTINI model for complex biomolecules.
Profile of candidate/Requirements
- Expert in computational biophysics and/or chemistry with emphasis in molecular simulation
- Experience with the MARTINI force field (or similar approaches) will be considered a strong asset
- Advanced knowledge of GROMACS, NAMD or AMBER packages
- programming skills preferably python >2.7, c++, Lua and experience writing scripts for HPC
- Capability and interest to present their investigation results in national and international conferences
- Good command of English
- Reliability, creativity, ability to work in an interdisciplinary group
We offer
- Attractive salary: 9750 PLN gross monthly,
- Support for travel to international conferences
- Short stays in our collaborator's lab in Netherland and Belgium
- Support in grant preparation and a great environment to work
Requirement documents
- Cover letter
- CV including list of publication and conferences
- PhD diploma in physics/biophysics or a related branch of science
- Two recommendation letters
- Signed statement: “I agree to the processing of personal data contained in my job offer for the needs necessary to carry out the recruitment process conducted by IPPT PAN with headquarters in Warsaw, ul. A. Pawińskiego 5B, according to art. 13 para. 1 and 2 of Regulation (EU) 2016/679 of the Parliament and of the Council of 27 April 2016 on the protection of individuals with regard to the processing of personal data and the free movement of such data and the repeal of Directive 95/46 / EC (RODO).”
Please submit the documents to: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. with a copy (CC) to Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
For more details about the position please visit: http://pomalab.ippt.pan.pl/web/positions